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外贸公司进出口退税申报流程：1、外贸公司进出口退税申报系统和出口退税网，安装后根据服务器维护开展公司信息设定。2、根据出口退税系统软件进行出入口清单申请数据信息的入录、审批。3、获得增值发票后在税票开税票时间30天内，在“发票认证系统软件”或税务局开展发票信息验证。4、根据出口退税系统软件进行拿货清单申请数据信息的入录、审批。5、根据系统软件中“数据处理方法”的“拿货出入口总数关系查验”和“换汇成本查验”后转化成预申请数据信息。6、在网上预申请和查看审批意见反馈。7、在申报系统中入录报关单证办理备案数据信息。8、审批根据后，开展宣布申请，把预申请数据信息确定到宣布申请数据信息中。9、复印出入口清单申报单、拿货清单申报单、进出口退税申请明细表各2份；并转化成出口退税申请硬盘，硬盘中应当有12个文档，并在转化成好的出口退税硬盘上写上公司的名字和海关代码。10、提前准备出口退税申请材料，到出口退税科宣布申请出口退税；（必须在出入口时间算起90天内开展宣布申请）