1号线罗宝线-机场东站-机场接驳大巴（地铁站换乘到达T3航站楼所需大约为30分钟。）
1号线罗宝线-后瑞站-M416机场接驳公交（后瑞C出口离公交接驳线最近，地铁站换乘到达T3航站楼所需大约为10分钟。
从福田站出发：
换乘线路：2号线、3号线 换乘方式：站厅换乘 换乘时间：2分钟（预估）
福田站是11号线与2、3号线的换乘站。乘客可由站台层的扶梯、垂直电梯上至站厅，根据导向标示分别前往2、3号线站台换乘，或列车往碧头方向的一端扶梯可以前往3号线站台换乘。福田站将成为11号线开通后最为繁忙的车站之一。
从车公庙站出发：
换乘线路：1号线、7号线、9号线 换乘方式：站厅换乘 换乘时间：1号线与11号线换乘约2分钟（预估）； 1号线与7号线、9号线换乘约5分钟（预估）
车公庙站是深圳市轨道交通路网第一个四线换乘车站，随着轨道交通三期工程的陆续开通，将大大缓解车站周边市民的出行压力。同时，为方便乘客出行，车站站厅的天花板上安装了带有线路数字的导向光带，引导乘客通过站厅付费区的换乘大厅，更方便、快捷、准确地实现4线换乘。
从红树湾南站出发：
换乘线路： 9号线 换乘方式： 同台换乘 换乘时间： 20秒
红树湾南站是深圳地铁9号线的起点站与11号线的换乘车站，该站位于深圳市南山区著名景点深圳湾海滨公园北侧，白石四道和深湾二路交汇处地下。站厅、站台天花采用格栅式吊顶，简约、实用，通过灯光和导向共性元素相结合，呼应和谐主题，使整个空间协调统一；同时红树湾南站9、11号线采用同站台换乘，更方便乘客出行、换线。
从后海站出发：
换乘线路：2号线 换乘方式：通道换乘 换乘时间：6分钟（预估）
后海站是2、11号线的综合换乘站，车站周围有大型的“春茧”体育馆、多个大型写字楼、学校、高档住宅小区环绕，是集商务、娱乐、饮食、购物、住宅为一体的重要的轨道交通枢纽。该站设置南北向的换乘通道，将2、11号线站厅付费区连成一个整体，实现两线乘客无缝接驳；并在换乘通道设置平行扶梯，供乘客使用，缩短步行时间，快速换乘。
从前海湾站出发：
换乘线路：1、5号线 换乘方式：站厅换乘 换乘时间：2分钟（预估）
前海湾站位于前海自贸区内，周边区域尚待开发，但该区域具备海、陆、空区位优势，是未来亚太地区重要的生产性服务业中心，是世界服务贸易重要基地，将是商务人员高度聚集的区域，因此该车站将成为11号线最繁忙的车站之一。该站在站厅、站台付费区的醒目位置设立换乘导向，指引乘客通过站厅换乘，实现1、5、11号线3线快捷换乘。在前海湾站乘坐11号线，15分钟便可以到达福田中心区和深圳机场，大大缩短了市民出行时间。