从医学的原理来说衣原体感染的患者是比较小几率会在患病期间怀孕，但是任何事情都存在意外，而且衣原体感染后怀孕会有宝宝很大几率同样得病，因此在衣原体感染后怀孕要不要这个孩子看个人的选择。由于受精卵的本体就是带有衣原体，因此这样发育出来的孩子并不健康，最好在治愈之后再行准备怀孕。
衣原体是一种微生物，可以通过性交来传染。那么要是在衣原体感染后，能否怀孕呢？一般来说，当衣原体感染发生后，要怀孕是比较困难的。因为女性的宫颈会因为衣原体感染而发病，分泌物增多，不利于精子进入受孕。
一般来说女性患有衣原体感染后更多的是引起宫颈感染，这时候宫颈分泌物会明显增多，质地粘稠，并有大量白细胞，这对精子的活动度会产生不利影响，妨碍精子进入宫腔，影响受孕。因此衣原体感染后最好及时进行治疗，治愈衣原体感染后再怀孕比较好。
那么，衣原体感染该如何治疗呢？下面简单的来介绍下。一般来讲，常规消炎药对支原体、衣原体感染的治疗无效，有些药物在选择使用时因其针对个体差异不同而存在着不同程度的耐受性和副作用，因此应该尽量通过药敏试验进行选择使用。
对衣原体准确诊断，选择有效的治疗衣原体的药物，则可以取得好的疗效，建议在专科医生的指导下积极治疗，衣原体感染的疗程一般在一到两周左右，需要根据具体情况来定，有些衣原体感染的病人迁延不愈则可能是：第一次的治疗衣原体感染不彻底，只是感觉症状消失了，没有作相关检查就误认为痊愈而停止用药，其实衣原体并没有被完全杀死。建议治疗结束后应做相关检查以确定完全治愈。或者用药量不足或时间不够，不能达到有效治疗衣原体感染的目的，反而使病菌产生耐药等。需要找出原因，完善治疗。另外特别要注意的是夫妻需要同时治疗，在治疗衣原体感染期间禁止性生活，以免交叉感染。
总结，最好在衣原体感染治疗结束后做相关检查以确定完全治愈。再观察一段时间，如果夫妻都没有任何异常就可以怀孕了。这里再稍微补充下，当发生衣原体感染后，也是有可能怀孕的。但是带有这样的性病来怀孕，精子的质量可能受到衣原体感染的影响，不利于优生的计划。所以我们还是要强调，当患有衣原体感染后，最好再治愈后再怀孕。