厦门大学和厦门集美大学当然有区别。
厦门大学和厦门集美大学是各自独立办学的学校。
厦门大学是985工程院校，全国重点大学；
厦门大学，是教育部直属的全国重点大学，由教育部、福建省和厦门市共建，是国家“211工程”、“985工程”重点建设高校，是国家“2011计划”牵头高校。入选“111计划”、“珠峰计划”、“卓越工程师教育培养计划”、“卓越法律人才教育培养计划”、“卓越医生教育培养计划”、国家建设高水平大学公派研究生项目，是全国31所副部级中管高校。学校由著名爱国华侨领袖陈嘉庚先生于1921年创办，是中国近代教育史上第一所华侨创办的大学。
集美大学是省属学校
集美大学，是福建省重点建设高校，是交通运输部与福建省、国家海洋局与福建省、福建省与厦门市共建高校，拥有博士学位授予权。
1918年、著名爱国华侨领袖陈嘉庚先生创办的集美师范学校，1994年、在原集美航海学院、厦门水产学院、福建体育学院、集美财经高等专科学校、集美师范高等专科学校等五所高校的基础上合并组建集美大学。
2008年，学校以“优秀”成绩通过了教育部本科教学工作水平评估。集美大学在长期办学实践中形成了航海、水产等面向海洋的学科专业特色和优势，是我国培养高级航海人才的重要基地，航海教育在国内外有较大影响，水产学科在国内具有一定的优势和影响。
厦门大学重点学科和优势专业：
1、一级学科国家重点学科（5个）
理论经济学、应用经济学、化学、海洋科学、工商管理
2、二级学科国家重点学科（不含一级学科覆盖）（9个）：
国际法学、高等教育学、专门史、基础数学、凝聚态物理、动物学、水生生物学、细胞生物学、环境科学
3、福建省特色重点学科（17个）
理论经济学、应用经济学、法学、教育学、中国语言文学、中国史、物理学、生态学、统计学、仪器科学与技术、材料科学与工程、化学工程与技术、环境科学与工程、基础医学、管理科学与工程、工商管理、公共管理
4、福建省省级重点学科（46个）
哲学、理论经济学、应用经济学、法学、政治学、社会学、民族学、教育学、中国语言文学、外国语言文学、新闻传播学、考古学、中国史、世界史、数学、物理学、化学、海洋科学、生物学、生态学、统计学、机械工程、仪器科学与技术、材料科学与工程、电子科学与技术、信息与通信工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、建筑学、土木工程、化学工程与技术、航空宇航科学与技术、环境科学与工程、生物医学工程、软件工程、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学、管理科学与工程、工商管理、公共管理、音乐与舞蹈学、戏剧与影视学、美术学、设计学
5、国家级特色专业（17个）：
会计学、
金融学、
行政管理、
经济学、
财政学、
物理学、
英语、
法学、
历史学、
海洋科学、
化学、
生物科学、
统计学、
数学与应用数学、