南京站与南京南站重要的差别是:一、南京站停靠的火车动车与高铁较少，一般列车都停靠。
二、南京南站只停动车与高铁列车，一般列车不停靠。
三、南京站就在南京市区，南京南站阔别市区。
四、南京站范围较小，南京南站是我国最大年夜的火车站。