本来的20号线由广州南站至琶洲站。行经广州南站、会江东站（新）、大年夜石西站（新）、洛溪核心站（新）、沥滘站、海珠生态园站（新）、石榴岗站（新）、赤沙站（新）、琶洲站。现时该线曾经撤消，原有线位被新打算的城际铁路广佛环线西北半环所盘踞，20号线的号码亦被悬空。