经过多次调剂线路打算，根据最新发改委十三五轨道交通打算打算（2015-2021）。现在确认S6为老机场（顺内义）跟新容机场（大年夜兴）接洽线，原有牛栏山、马坡、顺义站确认撤消。
一期：
牛栏山（已撤消）
马坡（已撤消）
顺义（已撤消）
一期支线：
首都机场3号航站楼东
国门商务区
徐辛庄
龙旺庄
通运门
通州火车站
京州
万盛南街西口
亦庄火车站
北京地铁亦庄线
马驹桥
鹿海园
瀛海
磁各庄
黄村火车站
二期：
芦城
阎仙垡
广阳城
良乡火车站