抉择恰当的农药非常重要。番石榴果实蝇对很多农药都有必定的抵抗力，因此应抉择有效的农药。同时，也应当遵守农药利用标准，按照药剂量跟利用时光正确喷洒，避免挥霍跟适度利用。
公道的防治办法也很重要。除了利用农药外，还可能经由过程其他办法来防治番石榴果实蝇。比方，在果实成熟前及时采摘果实，清除果实四周的落叶跟杂草，增加益虫繁殖的情况。其余，还可能采取黄板诱虫、性信息素等防治方法，以达到更好的防治后果。
防治过程中应及时察看果实的情况。假如发明果实曾经感染了番石榴果实蝇，应破即将感染严重的果实摘上去，增加益虫传播。其余，不要将感染严重的果实留在果园中，免得益虫繁殖。