病菌重要以卵孢子跟菌丝体随病残体潜存在泥土中，前提合合时，卵孢子可直接萌收回长芽管入侵寄主致病，或产生无性态的孢囊梗跟孢子囊，孢子囊成熟时开释出游动孢子作为初次侵染接种体，借助浇灌水传播，从根部侵入致病。
病菌以卵孢子或菌丝体在泥土中存活，病菌从根部伤口侵入，借浇灌水传播蔓延，停止再感化。高温、高湿利于发病，轮作地、低洼地发病重。
根腐病病菌在病残体、泥土、粪肥中越冬,可存活10年以上,是重要的初侵来源。病菌可借助浇灌水传播播,也可随病土挪动、施用带菌粪肥及耕具等传播。根腐病病菌可从根部伤口开端入侵。
西葫芦根腐病传播道路,是从品种，泥土，灌溉传播蔓延。