有差别，主要的区别就是卖家不一样。
1、商品来源：
京东自营针对国内商品，商品由国内生产，货物由京东采购，在国内仓库发货配送，提供售后，并开具发票。货品质量由京东保障。
京东全球购的所有商品均属海外生产或销售。通过京东建立的京东香港平台实现直接与境外全球购商家签约。选购的商品均从海外或保税仓发至我们手中，配送物流稳定可靠，比一般国际物流周期短。
2、商业模式：
京东自营是京东B2C网络销售模式，也就是business to consumer,即商家直接到买家的模式。货物由京东采购，并负责配送，是一般进口贸易的商业模式。
京东全球购自营也是自营店，产品直接从海外采买。京东要求在全球购开店的商家必须是国外的公司及国外的品牌授权，台湾香港的公司也可以。
3、产品价格：
京东自营的产品零售价是由京东来定的，厂家或者品牌方决定的是供货给京东的批发价，大量的进口产品都需要进口报关税，所以京东自营和国内的进口代理商的零售价格是差不多的。
全球购的产品基本上就是国外的零售价格加一点运费和税点，有的商家可能把运费算到零售价格里面去了给包邮。所以全球购上购买只要是找的靠谱的商家价格方面的确是有优势的。
4、物流速度：
京东自营，你今天下单，明天就能到，国内目前还没有可以比拟的。
由于需海关清关，全球购的物流速度会比京东自营慢一些，但是却比国际物流快，因为京东全球购在广州、宁波、上海、重庆、天津落地自营保税仓，并与杭州、郑州等多地保税仓合作保税备货。
5、其他方面：
自营成本价的确是比国外直邮的全球购成本要高出很多。
全球购如果不是代理商而是品牌方或者厂家直接开的店，价格也会更便宜。
但是全球购的产品真伪的确不是很好保证，需要多方面对比。
(2)全球购总经理授权扩展资料
1、京东自营售后运费：
双免：双向免费，即上门取件和寄还均免费，取（返）件包含两种形式：
1）在京东取件范围内，可免费上门取件；
2）客户也可以采取自行发货（货到付款除外）寄回京东，如是京东原因导致的售后运费，运费将以京豆、优惠券或者余额方式返回。
单免：单向免费，即上门取件收费，京东寄回商品免费（退货因无寄回不享受该项服务），取（返）件包含三种形式：
1）京东配送上门取件时产生的运费需要客户承担；
2）客户通过第三方快递将商品寄回京东，运费自付；
3）客户将需换货的商品送达自提点，则免收运费。
PLUS会员、京享值≥20000会员免运费权益
（1）PLUS会员因客户原因导致商品退回京东，享受免费上门取件服务；
（2）京享值≥20000会员因客户原因导致商品退回京东，每月可享受3次运费双免权益，超过3次将收取相应运费。
2、京东全球购自营商品售后政策服务总则：
符合以下情况，自客户签收商品次日起7天内退货，1年内出现质量问题部分商品支持补偿维修费用（手机数码类、电脑类、家用电器类）。
所有商品暂不支持换货，补发，维修、安装。（退货请保持主商品完好，附件齐全，并将赠品一并返回）。
不予办理退货的情况：
（1）任何非京东自营出售的商品（序列号不符）；
（2）过保商品（超过三包保修期的商品）；
（3）未经授权的维修、误用、碰撞、疏忽、滥用、进液、事故、改动、不正确的安装所造成的商品质量问题，或撕毁、涂改标贴、机器序号、防伪标记；
（4）三包凭证信息与商品不符及被涂改的；
（5）其他依法或按照本规则规定不办理退货的。其他：在商品退货时，需扣除购买该商品时通过评价或晒单所获得的京豆及相应优惠，有赠品的主商品发生退货时，需将赠品一并提交退货返回，如赠品未退回，则主商品无法全额退款。