1号线 1号线连接罗湖口岸、火车站、市中心区、宝安中心区、深圳机场，采用地铁制式，总长约40.47公里。 罗湖口岸至世界之窗段为在建一期工程的一部分，线路长17.1公里；世界之窗至深圳机场段为近期优先发展线路，长23.37公里，投资约89.18亿元。 2号线 2号线连接市中心区、南山中心区及蛇口片区，为中心城区西部和中部连接市中心区的客运干线，采用地铁制式。 规划近中期发展的线路为蛇口西站至世界之窗，长14.21公里，投资约57.58亿元。 3号线 3号线连接福田中心区、罗湖中心区、布吉、横岗镇、龙岗中心城，为连接罗湖中心区和深圳东部的客运干线，采用地铁制式。 规划近中期发展的线路为红岭中心至龙兴街，长32.70公里，投资约118.29亿元。 4号线 4号线连接皇岗口岸、市中心区、龙华新区和龙华镇中心，为城市中部的南北向客运干线，采用地铁制式，长20.91公里。 其中皇岗口岸至少年宫段为在建一期工程的一部分，线路长4.5公里；少年宫至龙华新城中心段为近期优先发展线路，长16.41公里，投资约51.42亿元。 6号线 6号线从深圳机场引出，连接福永、沙井、松岗、公明、光明、石岩、龙华，并连接1号线、4号线和11号线，采用城市铁路制式。 全线长约51.8公里，投资约93.1亿元。 8号线 8号线连接罗湖中心区、莲塘、沙头角、盐田组团，并连接1号线和11号线，采用普通轻轨制式。全线长约19.2公里，投资约47.2亿元。 11号线 11号线充分利用平南铁路和平盐铁路既有通道，连接南山、龙华、坂田、横岗和盐田，并衔接1号线、2号线、3号线、4号线、6号线和8号线，全线长约53.5公里，投资约88.5亿元。其中深圳西站至塘坑段为近期优先发展线路，长约37公里，投资约61.8亿元。 12号线 12号线连接龙岗次中心区、大工业区及坑梓卫星新城，与3号线一起形成东部发展轴上的快速轨道交通走廊，采用城市铁路制式。 全线长约16.6公里，投资约29.2亿元。