截止2019年，商丘共有5个火车站，具体如下：
1、商丘南站
商丘南站位于河南省商丘市商丘新区南京东路。该站始建于1987年，于1989年10月建成投入运营。该站建筑面积24000平方米，站台规模为3台6线。商丘南站通过京九铁路、陇海铁路联络线接驳商丘站，隶属中国铁路郑州局集团有限公司商丘直属站管辖，现为三等站 。
2、商丘新区站
商丘新区站(商丘东站)位于河南省商丘市商丘新区商鼎路、商杭路、南海大道、洞庭湖路围合区域，上行距离商丘站15.91公里，工程于2018年9月1日开建。
车站采用线侧平站型，站台规模为2台4线（含正线），设到发线2条，站台2座，其中基本站台1座，侧式站台1座，旅客地道1座8米宽，隶属中国铁路郑州局集团有限公司商丘直属站管辖。
3、商丘站
商丘站（Shangqiu Railway Station）位于中国河南省商丘市，是中国铁路郑州局集团有限公司管辖的一等站，是陇海铁路和京九铁路的交汇站，是中国重要铁路交通枢纽之一。
商丘站始建于民国2年（1913年），原名朱集站；于民国22年（1933年）更名为商丘站；于1984年原址重建；2015年10月北站房开工建设；2018年2月北站房投入运营。
4、民权北站
民权北站位于河南省商丘市民权县江山大道与科研路交汇处。站房主体结构总长121米，总宽31米，檐口高度14.5米，建筑高度15.3米，站房主体一层，局部两层，站房建筑面积5000平方米，站台规模2台4线，由中国铁路郑州局集团有限公司郑州东站管辖。
2016年5月至7月，徐兰高速线郑徐段承担为期两个月的中国标准动车组试验任务，并于7月15日在民权县境内跑出了420公里的时速交汇试验，创造了动车速度的世界最高纪录。2016年9月10日，随着徐兰高速线郑徐段全线正式开通运营，民权北站正式投入使用。
5、永城北站
永城北站是徐兰高速铁路郑徐段的站点之一，位于河南省商丘市永城市区北35公里，南距芒砀山3.5公里，站房建筑面积5000平方米，站台规模为2台4线，由中国铁路上海局集团有限公司徐州直属站管辖。
2013年3月4日上午，由中铁三局承建的徐兰高速线郑徐段永城北站，正式向地下打入第一根桩，标志着徐兰高速线郑徐段永城北站正式开工建设。2016年9月10日，随着徐兰高速线郑徐段正式开通运营，永城北站正式投入使用。