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西红柿脐腐病属于生理性病害，主要是缺钙和鹏引起的。
此病是由水分供应失调、缺钙、缺硼等原因导致的生理性病害。
1、水分供应失调的影响。干旱时果实脐部最易失去水分引起组织坏死。在大量供水时，由于蒂部细胞膨压过大而使细胞破裂、细胞内充水，最后变色坏死。即水分过多、过少或忽多忽少造成的。2、缺钙的影响。多年连种，过量使用氮、磷肥，都会抑制对钙的吸收。果实中钙含量低于0.2%时易导致脐腐病发生。3、土壤层浅、沙性大、盐碱土发病重。4、不同品种发病程度不同。果皮较薄、果顶平及花痕较大的易发病。