1、游戏开始选择假名或是汉字模式。输入玩家角色名，无默认名。输入劲敌名，默认名为“ヒュウ”。从桧扇市玩家的家中开始游戏。基础徽章桧扇市与妈妈对话，得知博士的助手白露来到了桧扇市。出门向北走，遇到劲敌与劲敌的妹妹，与劲敌一起寻找白露。在桧扇市西北的眺望台找到白露，获得初始精灵(三选一)与精灵图鉴。与劲敌对战，劲敌使用的是克制玩家初始精灵属性的精灵。被白露带往精灵中心介绍各种设施与友谊商店，并获得10个怪兽球。走出精灵中心，遇到妈妈与劲敌的妹妹，获得跑鞋与两个城镇地图，要将其中一个交给劲敌。向北进入桧扇大门，被警卫拦住，得知主角拥有精灵后放行，并赠送一个伤药。前往19号路。19号路走出桧扇大门后遇到白露，学习捕捉精灵的方法(不能跳过)。向东走被阿戴克叫住，追寻他进入算木镇。算木镇进入算木镇后遇到阿戴克，得知他的家在算木镇西北。在阿戴克家前与他对话，让玩家以将城镇地图交给劲敌为优先。向东进入20号路。
2、毒徽章算木镇在算木镇北部被白露叫住，为玩家的图鉴升级，加入栖息地列表功能，并告知玩家摇晃的草丛要素。进入20号路。20号路原本挡路的山男见到基础徽章后与玩家进行对战，打败他后继续前进。
3、伏特徽章4号路在飞云市北部遇到アクロマ，与主角约定在4号路对战。在4号路上遇到アクロマ与挡路的岩殿居蟹群，アクロマ使岩殿居蟹离开，并与主角发生战斗，打败他后获得蛋白质。向北进入加盟大道。加盟大道遇见加盟大道的所有者，将加盟大道委托给玩家管理。依次输入口头禅、感动。
4、波浪徽章双龙市走出双龙道馆后，与夏卡对话，前往夏卡的家。ヴィオ出现，双龙市被冰封。打败城市中的三名等离子队的下属与双龙道馆前的ヴィオ。战斗结束后收到劲敌与切莲对话后，前往小波镇。小波镇在涟漪大门前接到劲敌的电话，通过海洋隧道前往青海波市。青海波市与劲敌对话。找到道馆馆主西子伊，前往挑战青海波道馆。青海波道馆打败道馆馆主西子伊，获得波浪徽章与TM55 沸水。精灵联盟青海波市走出青海波道馆后与劲敌及西子伊对话。前往22号路。