從1964年開通至今，新支線尚未產生過嚴重旅客傷亡變亂，但也絕非「零傷亡」、「零變亂」，新支線的歷史上同樣產生過很多次毛病跟變亂、偶然乃至走到了宏大年夜災害的傷害邊沿，最後可能逢凶化吉除了保險辦法得力之外很大年夜程度上也是靠了神來的好福氣。新支線在保險方面有一些值得稱讚的處所，但不該適度神話。
在探究新支線的保險性之前，起首應當明白「新支線」是什麼，因為很多人也包含不少媒體對日本鐵路缺乏懂得，根本分不清「新支線」與「在來線」、JR與私鐵&地下鐵的差別，常常會想固然地把一切日本鐵路都視為「新支線」，於是東京的山手線這種市內通勤鐵路出了運營毛病也稱之為「新支線變亂」，信樂高原鐵道這種單線內燃的處所鐵路出了變亂也稱之為「新支線變亂」......因此這裡起首要指出，新支線在日本法則中的定義是「重要區間內列車正常走行時速200公里以上的支線鐵道」，因為國際上一般以正常運轉時速200～250公里作為「高速鐵路」與傳統鐵路的分野，所以新支線=日本高速鐵路＜日本鐵路，新支線變亂=日本高鐵變亂＜日本鐵路變亂。假如論及日本鐵路變亂，則日本鐵路就團體而言同樣產生過各種大年夜大小小的變亂、包含多起形成了嚴重人員傷亡的變亂，如五六十年月的「戰後國鐵五大年夜變亂」，七十年月的北陸地道列車火警變亂，九十年月的信樂高原鐵道列車衝突變亂，以及2005年的JR福知山線列車脫線變亂，但這些變亂與作為高速鐵路的新支線體系並有關係。
秋田新支線產生脫軌變亂的路段大年夜致如上圖所示，但並非全線都如此。右側線路為擴軌後的1435mm准軌，注意左側線路實在有三根鐵軌，此即1067mm窄軌（在來線列車）與1435mm准軌（新支線列車）的「套軌」。
15.山形新支線道口變亂
2013年12月29日9時35分閣下，「翼」123號列車（400系擔當）于山形新支線運轉時在一處平交道口與汽車相撞，形成被撞汽車上一名女性逝世亡，列車乘客中有1人受重傷。如前所述，山形新支線是由既有線改革而來的「迷你新支線」，按照在來線標準停止管理，因此仍然存在大年夜量平交道口，不像標準規格新支線一樣實現線路全封閉化，如許的道口撞車變亂對標準規格的新支線來說是不堪假想的。
16.東海道新支線放火變亂
2015年6月30日11時閣下，一名女子在東京開往新大年夜阪的「盼望」225號列車（N700系擔當）1車廂內毀滅隨身攜帶的汽油，激發車廂內火警，列車在小田原附近緊急泊車後司機與列車員破即用滅火器將火毀滅。變亂形成兩人逝世亡，其中放火者在火警中身亡，同時1車廂一名女性乘客因吸入過多有毒煙氣而梗塞逝世亡，車上乘客跟車組人員中也有28人因吸入有毒煙氣而出院，1號車部分車內設備在火警中被焚毀。變亂招致東海道新支線全線運轉中斷，當天高低行合計36班列車停運。
根據考察，該放火女子可能是因為生活不如意產生心思跟精力成績，遂抉擇在新支線列車上放火自殘。為根絕此類變亂再度產生，各JR公司紛紛採取辦法加強新支線的乘車安檢，進一步強化列車員對車廂內的巡查，並增加車內攝像優等。
17.山陽新支線車輛部件零落變亂
2015年8月8日17時27分閣下，「櫻」561號列車（N700系擔當）在山陽新支線小倉-博多區間運轉時，2號車底部用於覆蓋車底設備的防護罩忽然零落並擊中了3號車側壁，招致一名坐在靠窗地位的女乘客被擊傷，隨後零落的部件又彈飛到接觸線上並形成接觸線短路停電，包含變亂列車在內的3趟列車因故在運轉中緊急泊車，約1萬5000人出行遭到影響。根據過後考察，部件零落的原因可能是測驗功課時違規操縱不擰緊螺栓。此次變亂是新支線歷史上第二起運營方負有義務的旅主人身侵害變亂。
18.熊當地動
2016年4月14日21時26分，熊本縣產生里氏6.5級地動，此次地動是4月16日凌晨熊當地區里氏7.3級地動的前震。受14日的6.5級地動影響，一列由熊本站向熊本綜合車輛所回送中的800系列車在九州新支線鹿兒島線正線上脫軌，幸無人員傷亡，此為新支線歷史上第五起列車脫軌變亂。因為熊本列車脫線變亂，加之震後九州新支線多處橋墩呈現裂紋，當日九州新支線全線停運，其後受16日熊本7.3級地動影響，九州新支線至4月27日方恢復全線正常運營。