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有多種多樣病症都跟支原體感染相幹。支原體在感染肺臟後可形成非典範性肺炎，在近來多少年，這類非典範性肺炎抱病率非常高，因為他基本上沒什麼特異性重要表示，因此在臨床醫學上也非常輕易被錯診。那麼肺炎衣原體感染的原因有什麼呢？
該病之病原菌為肺炎衣原體。1965年Grayston初次在一台灣少年兒童之結膜炎分必物中，分別出來出一株與其余支原體不一樣的支原體，當時間取名為TW(Taiwan)-183。1983年又在美國西雅圖1名亞急性呼吸體系感染的在校大年夜老師咽喉部分必物中，分別出來出另一株支原體而取名為AR-39(acuterespiratory-39)，後經科學研究評定，察覺此兩棵實則同一種支原體，其包容體外形與鸚鵡熱支原體鄰近，但其網狀構造體超微構造、單克隆抗體反應及DNA同源性均差別於砂眼及鸚鵡熱支原體，1989年發布取名為TWAR，別稱肺炎衣原體，為支原體屬中之第三種支原體。
肺炎衣原體的外形與另二種支原體有不一樣，但類似鸚鵡熱支原體，包容體為高密度橢圓狀，不糖元碘染色劑呈陰性。透射電鏡下原體典範性為梨型，也可能呈多形性，均值直徑380nm，周邊原槳區很大年夜;始體為球型，均值直徑510nm。
肺炎衣原體的關鍵外膜蛋白(MOMP)為關鍵構造蛋白，其最重要的是熱休克蛋白(HSP)，是其關鍵的發病物質，特別是在與血管子宮內膜侵害及主動脈粥樣硬化的產生息息相關。現階段孰知有兩個血清型。
構造塑造較其余支原體艱巨，能用Hela體細胞、229體細胞、HEP-2(人喉癌)體細胞、McCoy體細胞及MTED(人支氣管上皮細胞)細胞培養，在其中HEP-2體細胞最比較敏感。