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肛瘘也是临床上常见疾病，一般情况下肛瘘是需要做手术治疗的，具体是保守治疗还是手术治疗和肛瘘的类型以及严重程度有关系，复杂性肛瘘也是肛瘘的一种类型，而复杂性肛瘘在治疗之前是需要做好鉴别诊断的，同时要考虑到复杂性肛瘘的症状，那么复杂性肛瘘的鉴别诊断有哪些呢？
1.肛瘘一般通过患者的病史及临床体征都能有明确的诊断，绝大多数肛瘘患者有肛周脓肿的病史，表现为破溃、流脓，肛门部检查可触及条索状肿块向肛门部延伸。复杂性肛瘘发病从男女比率上来看，女性肛瘘的发病率较男性肛瘘低。有人推测性激素的影响是肛瘘发生的主要原因。在青春期，人体自身的性激素开始活跃，随即一部分皮脂腺，特别是肛腺开始发育增殖，关于复杂性肛瘘，男青年较女性增生明显。
2.如果考虑是复杂性肛瘘，随着医学的进步，现在的检查方法也是非常的多样。最简单的是做肛门的指诊以及肛门镜。在肛门指诊的时候能够摸到条索状的瘘管，有的时候能够在肛门的齿线附近摸到一个凹陷或者硬结，通常就是肛瘘的内口部位。如果在肛门镜下，可以看到一个凹陷或者暗红区域，这个也有可能是内口的部位。
3.如果准确的诊断，还可以用亚甲蓝造影，亚甲蓝染色或者亚甲蓝流出的部位是瘘管通向内口的部位。如果还有更加复杂的高位复杂性肛瘘，想进一步精准的诊断，现在有CT、有腔内B超还有核磁。临床上比较推荐的检查办法是腔内B超或者核磁。有一些医院可能不具备腔内B超或者核磁，这种情况下治疗高位复杂性肛瘘，经验比办法更重要。所以，一定要在正规单位找正规的肛肠科大夫治疗，否则会造成肛门部严重的损伤，产生非常恶劣的后果。