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孕囊一般来说是孕妇初期怀孕的状态，胎儿的诞生也是在孕囊里。出现空孕囊说明胚胎没有发育好。这就说明出现空孕囊不仅仅是因为精子的原因，还有可能是因为卵子的原因。空孕囊有可能是因为精子在一段时间内没有进入受精卵，或者是卵子的发育不够好。一般来说，出现空孕囊的话，孕妇就有比较大的流产的可能性。
孕囊也算子宫外孕的一种产物。
受精卵在7天时由于发炎、粘连等某些因素未进入子宫，通常宫外孕都会大出血，一般来说胎儿无法存活。小宝宝的母亲本身是宫内妊娠，但由于子宫发育不良，孕囊从子宫薄弱的顶端撑破，进入了腹腔，孕囊周围的绒毛在腹腔内到处寻求养分，再通过胎盘供给胎儿。通常这样的胎儿由于没有子宫大环境的保护，生存环境极为恶劣，营养也比较差，正常两个月内胎儿就会死亡。
一般情况下，孕囊偏小可能是由于情绪紧张等。
导致准孕妇月经推迟、排卵期后错、受孕时间晚，从而出现孕囊较实际停经天数小。例如，停经50天，但检查中却发现孕囊仅有40天左右大小。这种孕囊偏小属正常情况，只要经一周动态检查，显示绒毛膜促性腺激素及孕酮值在逐渐增多，孕囊继续生长，并且逐渐出现了胎芽和胎心，即说明孕囊偏小是生理原因所致，可继续妊娠。
如果是由于在孕期感染支原体、衣原体、风疹病毒等原因，导致孕囊发育不良，小于正常月份，孕囊是不健康的，会流产，最好到正规医院做清宫术，然后查明原因对症治疗，一年后再行怀孕。
由于精子、卵子发育不良。
孕妇在孕期感染支原体、衣原体、风疹病毒或孕妇在怀孕期间接触到有毒有害物质等原因，导致孕囊发育不良，小于正常月份。出现以上情况的孕妇在妊娠期随着时间的推移孕囊会继续长大，但见不到胎芽和胎心，这种情况下的孕囊是不健康的，最终会导致孕妇流产。