1、北京地铁运营公司。
其前身为北京市地下铁道总公司，是国有独资的特大型专门经营城市轨道交通运营线网的专业运营商。拥有职工一万余名。公司经营的线路包括1号线、2号线、5号线、6号线、7号线、8号线、9号线一期、10号线、13号线、15号线、八通线、房山线、昌平线、亦庄线、机场专线、和S1线，运营线路总里程500公里，共有303座运营车站。
2、北京京港地铁有限公司。
成立于2006年1月16日，是由北京市基础设施投资有限公司出资2%，北京首都创业集团有限公司和香港铁路有限公司各出资49%组建而成的合作企业。建设并运营北京的地铁4号线、14号线、16号线，并负责运营管理大兴线,还将以租赁经营模式运营17号线。线路总里程196.8公里，已开通运营里程约125公里，所辖车站78座。
3、北京京城地铁有限公司。
京城地铁主营业务是通过收购地铁运营权实现票务分账、商业投资等收益。按照京投集团的定位，中国城轨未来发展的模板应该是“”港铁公司“”，业务重心将向地铁经营倾斜，这样会让公司的资产变得更“轻”。目前运营机场线。
4、北京市轨道交通运营有限公司。公司成立于2016年04月13日，注册地位于北京市丰台区南四环西路188号7区3号楼，法定代表人为贾敬东。经营范围包括轨道交通运营管理；设计、制作、代理、发布广告。目前运营燕房线。
(3)经营地铁站扩展阅读
北京地铁建设历史
北京地铁始建于1965年7月1日，1969年10月1日第一条地铁线路建成通车，使北京成为中国第一个拥有地铁的城市。在20世纪50年代末期中国开始规划在北京、沈阳、上海三座重要城市修建地铁。
北京地铁首先开工，一期工程于1965年7月1日开工建设，其线路沿长安街与北京城墙南缘自西向东贯穿北京市区，连接西山的卫戍部队驻地和北京站，采用明挖回埋法施工。全长23.6公里，设17座车站和一座车辆段（古城车辆段），1969年10月1日建成通车。