深圳地鐵號線現在程經蛇口片區、南山核心區、下穿歡樂谷、華裔城、安托山後沿僑噴鼻路行進。沿蓮花路、新洲路至深南小道東行，經福田核心區、核心公園、華強北片區。從荔枝公園轉入深南路，設大年夜劇院站、湖貝站、黃貝嶺站，繞過新秀破交後達到起點新秀站。三期開通運營後，區間將延長至赤灣站到鹽田路站，沿路過過蓮塘片區，沙頭角片區鹽田片區跟梅沙片區。
1. 赤灣站：是2號線工程的出發點站，接蛇口西車輛段。
A、B出進口：預留
C出進口：港航路
公交代駁：M371（單邊）、226（單邊）、329（單邊）、B601（單邊）、B600
2. 蛇口港站：位於蛇口客運港前、港灣小道南側。
A、B、D2：預留，接口尚未開通
C：蛇口客運碼頭
D：中集集團（CIM C）
公交代駁：113、226、328、329、332、70、77、M371、204、B601、B687、J1、K 105、K 113等。
3. 海上世界站：位於太子路上、太子廣場前，計劃與12號線（南寶線）換乘。
AB：暫未開通
C：七天假日旅店
D：金融核心、南洋貿易銀行蛇口支行
公交代駁：77、204、226、331、332、M371、B 687、K 105、K 204等
4. 水灣站：位於南水路上，水灣路西側。
A、B：預留，尚未開通。
C：公園路、招商路、蛇口新街
D：水灣路、太子路、荔園路
公交代駁：77、331、M371、B602等
5. 東角頭站：位於南水路與蛇口新街穿插口。
C：預留，尚未開通
A：蛇口菜市場、蛇口大年夜廈、漁二村、中國海關
B：蛇口廣場、蛇口油庫、東角頭美食休閑城
D：蛇口國平易近病院、蛇口影劇院、蛇口小學、蛇口中學
公交代駁：19、37、79、80、J1、B737等
6. 灣廈站：位於後海濱路上，招商東路南側。
A：澳城花園旅店、澳城花園
B：育才集團小學、弘都世紀公寓、出色維港
C：育才三中、星海華庭
D：金色陽光雅居、後海私邸、東帝海景花園
公交代駁：B802
7. 海月站：位於後海濱路與產業八路穿插口。
A：邃古新城地下貿易南廣場
B：邃古新城地下貿易北廣場
C：招商海月花園
D：天驕華庭
公交代駁：B 700、B737
8. 登良站：位於後海濱路上、登良路南側。
A：後海濱路、東濱路、後海小道
B：後海濱路
C：後海濱路、登良路、龍城路
D：後海濱路、登良路、龍城路
E：後海濱路、東濱路、北師大年夜附中
公交代駁：B794
9. 後海站：位於後海濱路與海德二道穿插口。與地鐵11號線（機場線）換乘
A：深圳灣體育館
C：暫未開通
D1跟D2：凱賓斯基旅店
E1：保利劇院、保利文化核心、海岸城
E2：連接保利文化核心物業區
公交代駁：72（單邊）、J1（單邊）、B814、121、229、B605、J1等
10. 科苑站：位於高新南十道上、科苑南路東側，車站間距為2273m，本站為地下二層島式站台車站，
A：彈丸之地
B：彈丸之地、彩虹之岸、濱福庭園、陽光帶海濱城
C：留老師創業大年夜廈、威新軟件科技園
D：武漢大年夜學深圳產學研大年夜樓
公交代駁：109、B682、B814 、M208
11. 紅樹灣站：位於白石三道上、深灣一路東側。
A：濱海實驗小學
B：室廬小區
C：暫不開通
D：沙河公交總站
公交代駁：109、58、B 610、B 795、B795
12. 世界之窗站：位於深南小道，與1號線（羅寶線）換乘，首通段起點折返站。
A：歡樂谷，益田假日廣場東門
C1：深南路北側，沙河世紀廣場
H1：深南路南側，世界之窗泊車場
H2：深南路南側
I：深南路南側，世界之窗泊車場
J：深南路南側，世界之窗正門
B、C2：因益田假日廣場臨時封閉
公交代駁：旅行巴士線、21、26、32、54、59、79、90、101、109、113等
13. 僑城北站：位於僑噴鼻路路中，中航沙河產業區南側。
14. 深康站：位於深康村，僑城東路西側。
15. 安托山站：位於僑噴鼻四道。與7號線（西麗線）換乘。
16. 僑噴鼻站：位於僑噴鼻路、農園路路口。
17. 噴鼻蜜站：位於僑噴鼻路、噴鼻蜜湖東側。
18. 噴鼻梅北站：位於僑噴鼻路，噴鼻梅北路西側。
19. 景田站：位於蓮花路，景田路東側。與9號線（梅林線）換乘。
20. 蓮花西站：位於新洲路，紅荔路路口。
21. 福田站：位於深南小道，平易近田路東側。
與3號線（龍崗線）/11號線（機場快線）/廣深港客運專線福田站換乘。
22. 市平易近核心站：位於深南小道，金田路西側。與4號線（龍華線）換乘。
23. 崗廈北站：位於深南小道，彩田路東側。
24. 華強北站：位於振華路、華強北路西側。與7號線（西麗線）換乘。
25. 燕南站：位於振華路、上步路西側。
26. 大年夜劇院站：位於深南小道、大年夜劇院南側。與1號線（羅寶線）換乘。
27. 湖貝站：位於深南小道、東門中路東側。
28. 黃貝嶺站：位於深南小道、北斗路路口。與5號線（環中線）換乘
29. 新秀站：位於新秀路、羅芳路口。
（以下站點建立中暫未開通）[4]
30.蓮塘港口站：位於羅沙公路以南，延芳路以西，西嶺花園西側山腳。
31.仙湖路站：位於國威路與仙湖路穿插口處。
32：蓮塘站：位於國威路與畔山路穿插口處。
33：梧桐山南站：位於羅湖區羅沙路北側，車站高出公交集團地塊及梧桐山國度風景管理區。
34：沙頭角站：位於深鹽路與園林路穿插口處，沿深鹽路東西向安排。
35：海山站：位於鹽田區深鹽路，噴鼻徑南街與海山路之間。
36：鹽田港西站：位於鹽田區深鹽路與海景二路穿插口西側，東部陽光花園小區跟威明電子無限公司之間。
37：深外高中站：鹽田路與中青一路交口處，中青一路下。
38：鹽田路站：位於鹽田區鹽田路與東海道穿插口西側，北部富基金港小區跟吉兆業泊車場之間。
（以下站點打算中）
39：北山道站（打算中)
40：鹽田海鮮街站（打算中)
41：鹽田港東站(打算中)
42：大年夜梅沙站（打算中)
43.：小梅沙站（打算中）