石榴树发生煤污病时，由于菌丝的形成和作用，导致果实颜色加深，最终变为黑色或深褐色。以下是详细的解释：菌丝的作用：煤污病中的病菌在叶、果表皮上形成菌丝层，这些菌丝不仅作为菌体存在，还能够分解果实中的纤维素（如淀粉）和蛋白质。分解作用影响果实。

病菌在土壤内及植物残体上越冬，环境条件适宜时产生分生孢子，借风雨及蚜虫、白粉虱等传播蔓延。光照弱、湿度大的棚室发病重，多从植株下部叶片开始发病。高温高湿，遇雨或连阴雨天气，特别是阵雨转晴，或气温高、田间湿度大利于分生孢子的产生和萌发，易导致。